Thermo Fisher Scientific Amplitude Solution

基因组学 / COVID-19

赛默飞世尔科技 Amplitude 解决方案是一个高通量的自动化分子诊断测试解决方案。

最重要的是,Tecan是唯一一家以真正的合作精神来帮助我们应对所面临挑战的公司。

Elliot Shelton, General Manager

迎接COVID-19高通量筛选的挑战

COVID-19大流行给全球各地的诊断实验室带来了巨大压力,尽管试剂和实验器皿短缺,但许多实验室仍超越了以往的设想,处理前所未有的样本量。赛默飞世尔科技公司已经为世界各地的实验室提供了不可或缺的qPCR设备,并通过开发可实现高通量诊断筛选的自动化解决方案来协助这一努力。

 

需要更高的吞吐量

赛默飞世尔科技公司的遗传科学部(GSD)是遗传检测研究产品的领先供应商,qPCR是其产品组合中的主要产品。随着qPCR成为SARS-CoV-2鉴定的黄金标准,许多实验室向赛默飞世尔科技公司寻求临床检测方面的帮助。作为回应,该公司生产了TaqPath™ COVID-19组合试剂盒,并很快获得了FDA的紧急使用授权(EUA)。虽然这对实验室有很大的帮助,但还不足以应对许多实验室面临的测试量大增的问题,因此GSD总经理Elliot Shelton和研发总监Robert Balog受命实施一套自动化解决方案,每天可处理多达10,000次COVID-19测试。Robert解释说: "我们的起点是手动TaqPath检测,我们首先求助于内部资源,试图找到实现自动化的途径。我们很快意识到,我们需要外部合作伙伴的参与,并开始研究不同的液体处理方案。不用说,我们很快就发现Tecan是最佳选择。

 

迎接挑战

其中一个问题是,许多实验室没有足够大的生物安全2级(BSL-2)区域来容纳完整的工作流程。为了解决这个问题,赛默飞世尔科技团队围绕两个独立的Fluent®自动化工作站设计了Amplitude™解决方案,以适应不同规模和布局的实验室。罗伯特继续说道: "第一套系统是Fluent 1080平台,在BSL-2实验室处理活病毒,处理样品后,将其分装到4个96深孔板中,此时不再有任何活病毒。然后将这些平板转移到Fluent 780上,Fluent 780可放置在标准实验室中,并将样品合并到一个384孔平板中,进行RNA提取、qPCR和分析。

"挑战的第二部分是软件;我们必须开发能够帮助用户管理工作效率和跟踪数据的软件。我们已经有了与Fluent脚本兼容的API,但得到了Tecan团队的帮助,为每个客户定制软件。因此,该系统拥有一个单一的LIMS系统,可连接工作流程的两个阶段,并存储来自条码板的所有样品跟踪信息。该系统为实验室提供了一个完整的工作流程,每天可处理多达8000个样品"。

 

危机中的快速部署

Amplitude解决方案于2020年9月上线,得到了客户的积极响应。Elliot解释说: "当我们接受这项挑战时,我们并不知道它将会带来什么,但COVID-19检测的高通量需求是显而易见的,而目前的技术却无法满足这一需求。很高兴看到新开发的系统如此迅速地成为实验室的一部分,我们的团队能够如此迅速地完成订单并安排安装。如果没有Tecan,我们不可能做到这一点;面对如此空前的需求,能够协调足够的现场支持以成功安装和培训用户使用这些机器非常重要。此外,Tecan的全球业务使我们能够在世界各地迅速完成安装。