Codex DNA BioXp 3200

基因组学 / COVID-19

BioXp 3200系统先进的基因组装技术使科学家能够快速开发合成基因组和基因组部分,用于研究和开发活动。

我们非常满意与Tecan的合作关系。展望未来,我们将为我们的BET产品组合制定清晰的产品开发路线图。

Dr Dan Gibson, inventor of Gibson Assembly® molecular cloning methodology and Chief Technology Officer at Codex DNA

打印自己的DNA--疫苗开发的蓝图

应对席卷全球的COVID-19大流行需要快速开发新的诊断测试、治疗方法,更重要的是疫苗。Codex DNA先进的基因组装技术使科学家们能够快速开发合成的SARS-CoV-2基因组和基因组部分,为研发活动提供了强有力的工具。该公司的BioXp™ 3200系统使全球研究人员能够在自己的实验室中快速构建合成基因构建体,加快疫苗、治疗和诊断检测的设计和交付工作流程。

 

满足大流行病疫苗开发的需求

BioXp 3200系统起源于另一次病毒大流行的威胁。在H1N1(猪流感)大流行之后,美国政府和制药行业的合作者找到Gibson博士,要求他设计合成生物学技术,以便快速生产合成H1N1病毒基因组构建体,用于开发有效疫苗,克服分离传染性材料并将其分配给疫苗开发人员的关键挑战。仅仅几年后,中国出现了H7N9(禽流感)大流行流感病毒株,合成生物学技术与BioXp 3200系统原型相结合,大大加快了H7N9大流行疫苗的开发进程。

为了达到所需的产量和精度,Codex DNA(前身为SGI-DNA)的团队开发了一个自动化平台,他们意识到向全球提供基因构建体的最有效方式是让客户能够在自己的实验室中生成基因构建体。这将使实验室能够在几小时或几天内完成手工操作需要几周或几个月才能完成的工作。Codex DNA工程与仪器副总裁Laurence Warden解释说: "我们决定在公司内部进行整个系统开发项目,从头开始创建一个平台。唯一的例外是液体处理部件。我们的方案需要大量的液体转移,从3或4微升到180微升不等,根据经验,我们知道为这种应用开发精确可靠的移液器是非常困难的。

 

应对COVID-19

BioXp 3200系统于2015年推出,目前全球安装量已达数百套,完全能够帮助实验室研究SARS-CoV-2病毒,开发新型疫苗、治疗剂和诊断方法。"我们系统的一个独特之处是,每个订单都包括一个完全定制的试剂盒,该试剂盒专门针对正在构建的构建体。得益于我们在生物信息学、DNA设计和制造方面的内部专业知识和能力,从客户将其基因序列输入我们的在线订购门户到试剂盒发货,通常不超过24小时。在当前的COVID-19危机中,这种快速的周转时间对于加快疫苗开发研究至关重要,我们在首个SARS-CoV-2基因组序列公布后数小时就开始收到用于疫苗开发的构建体订单。

 

加快产品上市时间

Codex DNA团队选择Cavro®空气活塞移液器(ADP)作为最适合其应用的移液器,因为它设计紧凑,具有内置吸头排出功能,更重要的是,它还具有基于压力的液面检测(pLLD)功能。"ADP的pLLD功能使我们能够开发自动校准算法,为每个移液步骤确定正确的Z高度。从项目开始到生产出第一台仪器,我们用了18个月的时间。

尽管当时ADP刚刚推出不久,但Codex DNA以前使用Tecan液体处理平台和组件的经验使他们相信ADP的构造和可靠性。"Tecan的工程师与我们合作,克服了集成过程早期的一些挑战,我们的测试平台已经成功完成了我们设计规范中规定的三倍以上的运行次数"。

 

增加了优化系统分析和客户服务的功能

ADP的压力传感功能已被证明是Codex DNA的一个有用的分析工具,如果在基因组装过程中出现问题,团队可以回过头来查看数据记录。"能够查看每个移液步骤的压力记录,使我们能够检查,例如,在吸液过程中是否有箔片或碎片堵塞吸头而导致压力骤增。Codex DNA首席商务官Brian Donnelly补充说:"这对故障排除极为有利,并提供了利用机器学习算法的机会,以便根据这些日志和错误代码的可用性主动支持和监控仪器。

 

应对COVID-19

BioXp 3200系统于2015年推出,目前全球安装量已达数百套,完全能够帮助实验室研究SARS-CoV-2病毒,开发新型疫苗、治疗剂和诊断方法。"我们系统的一个独特之处是,每个订单都包括一个完全定制的试剂盒,该试剂盒专门针对正在构建的构建体。得益于我们在生物信息学、DNA设计和制造方面的内部专业知识和能力,从客户将其基因序列输入我们的在线订购门户到试剂盒发货,通常不超过24小时。在当前的COVID-19危机中,这种快速的周转时间对于加快疫苗开发研究至关重要,我们在首个SARS-CoV-2基因组序列公布后数小时就开始收到用于疫苗开发的构建体订单。

 

ADP产品亮点:

  • 完全可编程气动移液 - 满足您独特的应用需求
  • 出色的分辨率 - 每个增量仅为25ml(1,000 μl为40,000个增量)
  • 移液范围广 – 从5 μl到1000 μl
  • 工艺安全 - 集成误差处理、喷嘴存在传感器和高分辨率压力传感器
  • 免维护设计 – 长期可靠运行
  • 可选Tecan一次性吸头 - 10、50、200和1,000 μl吸头,满足您的应用需求
  • 喷嘴弹射装置 – 简化集成

 

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